В последующем, в соответствии с Федеральным законом «О Следственном комитете РФ» с 15 января 2011 года Следственный комитет при прокуратуре РФ преобразован в Следственный комитет РФ. Тогда следственные подразделения, на которые возложены задачи по расследованию наиболее тяжких преступлений, были выведены из состава органов прокуратуры и стали процессуально независимы.

Сегодня штатная численность Следственного управления Следственного комитета РФ по Архангельской области и Ненецкому автономному округу составляет 214 единиц, из которых 91 следователь, помимо следователей несут службу следователи - криминалисты, старшие помощники руководителя управления, руководители подразделений, следственных отделов, их заместители, инспекторы, эксперты, помощники следователей и другие.

Структура Следственного управления включает в себя аппарат управления, состоящий из 8 подразделений (отделов по расследованию особо-важных дел, процессуального контроля, криминалистики, организационно-контрольного отдела, отдела кадров, отдела по приему граждан и документационному обеспечению, отделов материально-технического и финансового обеспечения), непосредственно руководителю подчиняются старшие помощники руководителя управления (по взаимодействию со СМИ, статистическому обеспечению), старший инспектор (по защите государственной тайны и мобилизационной работе), а также 17 территориальных следственных отделов.

Только за последние 6 лет следователями управления направлено в суды более 5500 уголовных дел, из них более 1000 по фактам совершения убийств и умышленного причинения тяжкого вреда здоровью, повлекшего по неосторожности смерть потерпевшего, свыше 700 - по фактам совершения преступлений против половой неприкосновенности и половой свободы личности, более 600 коррупционных преступлений, расследовано около 350 преступлений прошлых лет, рассмотрено более 8000 обращений граждан.